苏北浅滩生态监控区  生态系统处于亚健康状态。水体氮磷比失衡，局部水域活性磷酸盐含量超第四类海水水质标准。近10%海域沉积物中硫化物含量超第一类海洋沉积物质量标准。部分生物体内铅含量偏高。生物群落结构状况一般，春季，浮游植物密度偏低，平均为3.4×10⁴个细胞/立方米；春季和夏季，浮游动物密度明显偏低，平均值分别为2 504个/立方米和2 278个/立方米；鱼卵、仔鱼平均密度分别为4个/立方米和45尾/立方米。

　　连续五年的监测结果表明，苏北浅滩生态系统健康状况总体处于稳定状态。水体氮磷含量呈下降趋势，但水环境质量指数波动较大，水体富营养化、氮磷比失衡现象依然存在。底栖生物栖息密度和生物量始终偏低，尤其是潮间带生物资源衰退等生态问题仍然严重。滩涂围垦、陆源排污和过度捕捞等是威胁苏北浅滩湿地生态系统健康的主要因素。

 

　　长江口生态监控区  生态系统处于亚健康状态。水体富营养化严重，氮磷比严重失衡，春季和夏季，大部分水域无机氮和活性磷酸盐含量超第四类海水水质标准。全部生物残毒检测样品中石油烃和铅含量偏高，部分生物体内砷、镉和总汞含量偏高。生物群落结构异常，生物多样性和均匀度较差，夏季浮游植物密度偏高，平均为6 719×10⁴个细胞/立方米，生物多样性指数平均为1.71，均匀度平均为0.39；春季浮游动物密度偏低，平均为1 346个/立方米；春季底栖生物栖息密度偏高，为191个/平方米，生物多样性指数平均为1.95，均匀度平均为0.69；鱼卵、仔鱼密度低，平均密度分别为0.34个/百立方米和6尾/百立方米。

　　连续五年的监测结果表明，长江口生态系统健康状况总体稳定，但始终处于不健康和亚健康之间的临界状态。长江口水体富营养化、氮磷比失衡严重，水体溶解氧含量呈下降趋势，局部出现溶解氧低于2毫克/升的低氧区。部分生物体内铜、锌、砷、镉和铅含量偏高。长江口生物群落结构状况总体上仍然较差，长江冲淡水区域生物群落结构基本保持稳定；长江口门以内区域生物群落结构趋于简单，生物种类减少，生物多样性降低；渔业生物资源衰退等生态问题严重。陆源排污、长江来水量不足、各类海洋海岸工程建设和滩涂围垦等是威胁长江口生态系统健康的主要因素。