【宪法】独立后共颁布过三部宪法。现行宪法于1987年2月2日由全民投票通过，由阿基诺总统于同年2月11日宣布生效。该宪法规定：实行行政、立法、司法三权分立政体；总统拥有行政权，由选民直接选举产生，任期6年，不得连选连任；总统无权实施戒严法，无权解散国会，不得任意拘捕反对派；禁止军人干预政治；保障人权，取缔个人独裁统治；进行土地改革。目前菲国内正探讨进行宪政改革。

【议会】称国会。最高立法机构，由参、众两院组成。参议院由24名议员组成，由全国直接选举产生，任期6年，每三年改选1/2，可连任两届。众议院由250名议员组成，其中200名由各省、市按人口比例分配，从全国各选区选出；25名由参选获胜政党委派，另外25名由总统任命。众议员任期3年，可连任三届。本届国会于2007年7月选举产生。维拉（Manuel B.VILLAR）和德贝内西亚（Jose de VENECIA Jr.）当选参、众议长。2008年2月，诺格拉雷斯（Prospero NOGRALES）接替德贝内西亚任众议长；11月，恩里莱（Juan Ponce Enrile）接替维拉任参议长。

【政府】实行总统制。总统是国家元首、政府首脑兼武装部队总司令。本届内阁于2004年8月组成，此后略有调整。目前，内阁成员24名：副总统诺利·德卡斯特罗（Noli de CASTRO），文官长埃杜阿多·埃尔米塔（Eduardo ERMITA），外交部长阿尔韦托·罗慕洛（Alberto ROMULO），财政部长马格瑞托·特维兹（Margarito TEVES），司法部长劳尔·冈萨雷斯（Raul GONZALES），农业部长黄严辉（Arthur C. YAP），国防部长吉尔伯特·特奥多罗（Gilberto C.TEODORO），贸易与工业部长彼德·法维拉（Peter FAVILA），公共工程与公路部长荷摩吉尼斯·艾布丹尼(Hermogenes EBDANE)，教育部长杰斯利·拉普斯(Jesli A.LAPUS),劳工与就业部长阿尔图罗·布里翁(Arturo D.BRION)，预算与管理部长罗兰多·安达亚（Rolando ANDAYA），卫生部长费朗西斯科·杜克（Francisco T. DUQUE），土地改革部长纳塞尔·潘甘达南（Nasser C.PANGANDANAN）,内务与地方政务部长罗纳尔多·普诺（Ronaldo V.PUNO），环境与自然资源部长何塞·雅典沙（Jose ATIENZA），交通与通讯部长雷恩德洛·门多萨（Leandro R. MENDOZA），社会福利部长埃斯佩兰萨·卡布拉尔（Esperanza I. CABRAL），科技部长埃斯特莱拉·阿拉巴斯特罗（Estrella ALABASTRO），旅游部长约瑟夫·杜拉诺（Joseph Ace DURANO），能源部长安吉罗·雷耶斯（Angelo REYES），新闻部长兼总统府发言人伊格纳西奥·布涅（Ignacia “Toting” BUNYE），经济计划部长奥格斯托·桑托斯（Augusto SANTOS），国家安全顾问诺伯托·冈萨雷斯（Norberto B. GONZALES）。

【行政区划】 全国划分为吕宋、维萨亚和棉兰老三大部分。截止2006年3月，全国设有首都地区、科迪勒拉行政区、棉兰老穆斯林自治区等17个地区，下设79个省和117个市。

【司法机构】司法权属最高法院和各级法院。最高法院由１名首席法官和14名陪审法官组成，均由总统任命，拥有最高司法权；下设上诉法院、地方法院和市镇法院。2006年12月，最高法院首席法官阿特米奥·潘格尼班（Artemio V. PANGANIBAN）退休，由雷纳托·普诺（Reynato S.PUNO）法官接任。检察工作由司法部检察长办公室负责，总检察长霍文西托·苏诺（Jovencito R.ZUNO）。

【政党】有大小政党100余个，大多数为地方性小党。主要政党有：

（1）基督教穆斯林民主力量党（LAKAS-CMD）：执政党，也是最大政党，系前总统拉莫斯于1991年底创立，由人民力量党、全国基督教民主联盟、菲律宾穆斯林民主联盟、团结党等整合而成。主张实行两党制，通过修宪扩大地方政府权力，改革选举制度，将总统任期六年一届修改为四年一届，可连任两届；主张通过谈判实现民族和解，促进社会稳定。经济上重视农业发展，增加就业，扶助贫困，加快私有化进程；倡导经济外交，奉行开放政策。1992年该党在大选中获胜，成为执政党。1998年大选中败于菲律宾民众奋斗党联盟。2001年阿罗约就任总统后，该党成为执政联盟的核心。2002年10月，该党针对2004年大选，对执政联盟进行再次整合改组。该党全国主席是阿罗约总统，总裁是众议长诺格拉雷斯。前总统拉莫斯担任名誉主席。

（2）民族主义人民联盟（NPC—Nationalist People's Coalition），是前总统埃斯特拉达的执政党联盟—民众奋斗党（LAMP）成员之一。2000年10月，埃被弹劾后，该党成为独立党派。现为众议院第二大党。该党支持修改宪法。为防止总统权力过大，主张实行议会制政体及实行两党制，支持加快国有企业私有化。该党总裁是前众议员圣胡安（Frisco F. SAN JUAN）。

（3）摩洛民族解放阵线（Moro National Liberation Front，简称摩解）：南部穆斯林武装组织。1968年创立，旨在棉兰老地区建立独立的伊斯兰国家。1987年南部各省举行公投，建立由棉兰老岛四省组成的“棉兰老穆斯林自治区”（ARMM），密苏阿里任主席。1996年，政府与摩解达成和平协议。2001年，密苏阿里与阿罗约政府发生利益冲突，其支持者于11月在霍洛岛发动武装叛乱。政府迅速平叛，宣布密犯有叛乱罪。摩解另一派系的领导人胡安任该党主席。密潜逃至马来西亚沙巴，被马政府逮捕并于2002年1月引渡回菲。2007年2月，阿罗约总统下令执行与摩解的和平协议条款，希望通过和平、发展、多种信仰对话及国际合作实现与摩解的最终和解，解决菲南部冲突。

（4）摩洛伊斯兰解放阵线（Moro Islamic Liberation Front，简称摩伊解）：菲最大的穆斯林反政府组织。现有武装力量12500人，主要活跃在棉兰老岛。1978年，以哈希姆·萨拉马（Hashim SALAMAT）为首的强硬派从摩解脱离后建立。2003年萨马拉去世后，穆拉特（Al Haj Ebrahim MURAD）任主席。主张建立独立的伊斯兰国家，坚持武装斗争。摩伊解与政府虽多次签署停火协议，但均未能得到有效执行。2000年4月摩伊解与政府冲突升级为“全面战争”，摩伊解的营地被政府军全部攻占，其武装力量溃散后，继续以小股武装袭击政府军和民用设施。自2001年开始，阿罗约政府与摩伊解重开和谈，并曾签署停火协议与和平协议，但双方武装冲突仍时有发生。2003年，南部地区发生多起恐怖爆炸案件，政府认为是摩伊解所为，宣布通缉其主要领导人，威胁要将摩伊解列为恐怖组织。此后，在马来西亚协调下，双方进行多轮谈判，取得了一定进展，停战仍时断时续。

（5）菲律宾共产党（Communist Party of the Philippines）：成立于1930年，1967年发生分裂。1968年，在何塞·西逊（Jose SISON）主持下进行改组重建，此后发展迅速，20世纪80年代中期党员达到3万多人。主张通过武装斗争和建立统一战线，夺取国家政权。1969年，菲共在中吕宋建立新人民军，开展武装斗争。新人民军现有1.1万人。菲政府自1993年起与菲共举行和谈，使菲共成为合法政党。双方时谈时战，迄未达成实质性和平协议。“9·11事件”后，菲政府对新人民军采取了强硬措施，包括军事打击。2002年，菲政府将新人民军宣布为恐怖组织，并促使美国和欧盟也将新人民军列为国际恐怖组织，冻结其海外资产。菲共与政府关系破裂，双方和谈停顿。2003年底，菲政府与菲共领导的全国民主阵线在挪威奥斯陆进行两次非正式接触，并于2004年2月重启和谈。菲共提出希望菲政府敦促美政府将其从恐怖组织中除名。美方明确拒绝，并要求菲共先承诺停止一切恐怖活动。

其它政党有自由党（Liberal Party）、民主行动党（Aksyon Demokratiko）、地方发展优先党（Promdi-Probinsiya Muna Development lnitiative）、改革党（Reporma）、民主战斗党（LDP-Lanban ng Demokratikong Pilipino）、民族党（Nationalista Party）等。