尽管国际奥委会与国际反兴奋剂机构先后原谅了菲尔普斯吸食大麻的行为，但更大的麻烦却困扰着菲尔普斯。由于菲尔普斯吸毒所在的美国南卡罗莱纳州法律规定吸毒违法，当地警方正在考虑对这位“美国传奇英雄”进行刑事罪名指控，菲尔普斯将面临30天监禁的牢狱之灾。

菲尔普斯是在美国南卡罗莱纳州的里奇兰县境内吸食大麻的，按照该州的法律，拥有1盎司(大约相当于28.35克)或更少的大麻是一种轻度犯罪，初犯者将被处以200美元罚款和30天的监禁。

在《世界新闻报》报道了菲尔普斯是在南卡罗莱纳州大学的聚会上吸毒后，这位美国英雄立即进入了南卡罗莱纳州警方的视野。值得一提的是，菲尔普斯这次撞到了“枪口”上，因为他吸毒所在的里奇兰县警方首长莱昂·洛特，正是以对毒品的强硬态度而闻名。莱昂·洛特本人在接受美联社的采访时明确表示，如果查明菲尔普斯的确是在里奇兰县辖区内吸食大麻，该县警方将肯定会追究到底。他说：“这个案子跟其他没有什么不同，情况甚至还更加清晰，我们现在已经拥有某人在吸食毒品的照片，而他本人也已经承认，我们只要查明这件事在何处发生就可以了。”

负责菲尔普斯案件的南卡罗莱纳州官员克里斯·科文则向美国媒体透露，地方治安官的调查还需要收集更多的照片，作为指控菲尔普斯使用玻璃器皿吸食大麻而违反相关法律的证据，“我们的麻醉品部门正在整理我们掌握的信息，他们也正在讨论将以何种名义提出起诉。”不过，科文拒绝透露调查的详细情况。“我们的底线是，只要他违反了法律，只要他是在里奇兰县犯法，他就将被指控。菲尔普斯和每天因同样劣迹作奸犯科而被法办的人一样，不会有区别对待。”

虽然菲尔普斯承认吸毒，但是，他吸毒所在的私人聚会地点并不明确，南卡罗莱纳州大学已经告诉警方，目前没有证据说明菲尔普斯是在校园内吸毒的，因此，现在警方调查取证的关键在于菲尔普斯究竟是在何处吸食大麻，如果警方得到有力的证据，菲尔普斯将难逃法律制裁，并将面临最少30天的监狱生活，这恐怕是菲尔普斯最不愿意看到的。截至目前，菲尔普斯和他的经纪团队尚未就警方的强硬态度有所回应。