改革开放 40 年来，我国畜牧业综合生产能力持续提升，畜产品结构不断优化，质量安全保障体系进一步完善，产业综合素质显著增强，绿色发展稳步推进，畜牧业已成为农业农村经济的重要支柱产业之一，成为现代农业建设排头兵。推进可持续发展是当前和今后一个时期现代畜牧业建设的重点任务。
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畜禽疫病的发生与流行是制约我国养殖产业可持续发展的关键因素之一。同时，畜禽疫病还会对动物性食品的源头安全、人民健康以及生态环境造成严重危害。一些烈性畜禽传染病的暴发甚至还会给社会稳定和国家安全带来重大冲击。因此，新时期科学有效地防控畜禽疫病是我国养殖业实现转型升级与可持续发展的国家重大需求。文章从我国畜禽疫病防控的重要意义与历史成就切入，分析了我国畜禽疫病的流行现状及防控困难，并就此提出了未来科技创新的重点方向。
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长期以来，抗菌药为畜牧业的健康发展一直起着保驾护航的重要作用，并且在将来较长时期内，抗菌药仍是集约化养殖业防治细菌病的主要手段。但随着抗菌药在养殖业的广泛使用，耐药菌的出现有可能使人类重新回到对多种感染无药可用的“前抗生素”黑暗时代，抗菌药的耐药性逐渐发展成为全球面临的挑战性问题。鉴于此，文章主要讨论抗菌药给畜牧业养殖所带来的正面影响，以及抗菌药使用所引发的全球耐药性问题，并针对我国国情提出关于抗菌药物应用和耐药性监管的策略、建议及面临的风险。
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养殖环境优化调控和智能养殖技术与装备是现代规模化畜禽养殖的重要技术支撑。影响畜牧业可持续发展的生物安全问题、畜牧环保问题和畜禽产品质量安全问题都与养殖环境控制和养殖装备技术密切相关。文章提出了加快畜禽养殖环境调控与智能养殖技术研发与推广应用的相关建议，旨在为我国畜禽养殖业的绿色转型升级和健康可持续发展提供理论依据和技术支撑。
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畜禽遗传资源是国家基础性、战略性的生物资源之一，在我国现代农业发展中发挥着重要的作用。现代化畜禽遗传资源不但要为市场提供优质、安全和多样化的畜产品，同时也为促进地方农民增收、资源持续利用、生态和文化遗产保护等方面作出贡献。文章阐述了我国当前地方畜禽遗传资源保护理论依据、技术方法，以及现状与发展趋势，并针对今后的发展提出建议，进而为推动我国建设畜牧“种业强国”提供参考。
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种养结合循环发展是畜禽废弃物资源化利用的根本出路，种养结合是破解农业面源污染难题、践行绿色发展理念的重要举措。
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近 30 年，我国肉类加工业取得了快速发展，其产值达到 1.3 万亿元人民币，成为我国农产品加工和食品加工业的支柱产业，以及畜牧业供给侧改革的重要支撑点和突破点。随着经济社会的发展，肉类营养与人体健康得到越来越广泛的关注。在分析国内行业发展和国家战略的基础上，总结了发达国家的经验教训，剖析了我国 2020—2035 年肉类营养与人体健康研究的前沿科学技术问题，提出了我国肉类营养与人体健康领域的发展战略目标、战略思路、实施路径、战略内容、任务布局和保障措施。
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高性能计算技术作为国家战略需求，正日益受到各国的高度重视。美国基于对计算科学发展趋势及新一轮信息技术（IT）革命到来的认识，于2015年颁布了著名的“国家战略计算计划”（NSCI），指明了在未来一段内时间围绕高性能计算技术与产业发展的战略目标、任务、方向及发展路径，同时构建了组织架构、明确了各方面的责任分工，可谓是一份完整的国家战略计划。相较于美国NSCI计划的前瞻性、科学性及系统性，我们在决策定位、政策配套、政策与现实对接等方面还需要做大量深入、系统、现实的工作。否则，我们将难以走出“追赶—落后—再追赶”的怪圈。
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空间科学任务与其他航天任务的根本不同在于其产出。如果说应用类航天任务的产出是应用和服务，如通信、电视广播、导航、气象预报、海洋预报，资源勘察，以及土地规划和利用等，那么空间科学任务的产出则是对太空和宇宙的新发现和对其自然规律的新认识，以及由此形成的新的科学知识。因此，判断一个空间科学任务是否成功的核心要素是其是否有相应的科学产出。
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我国草原牧区是少数民族的主要聚居区，也是贫困人口的集中分布区，是我国脱贫攻坚的“硬骨头”。草原牧区通过生态草牧业产业扶贫，全国已有不少脱贫致富的成功案例。中国科学院生态草牧业扶贫工作由中国科学院植物研究所牵头，联合院内外多家单位在贵州省水城县开展“黑山羊草畜一体化”示范项目，并为云南省永善县肉牛养殖提供科技支撑，项目成果为草山草坡地区发展生态草牧业产业扶贫提供了可借鉴的成功经验。
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1979 年中科院桃源农业生态试验站建站以来，系统开展了区域农业生态系统优化管理、农业整体效益的提高和建立区域农业综合发展的技术体系与优化模式，并进行示范推广，为南方红壤丘陵区农田生态系统耕地地力提升和水土流失治理、区域农业结构调整和生态环境改善提供重要理论和技术支撑。
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