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“推进党的建设科学化、制度化、规范化”，“提高党的建设科学化水平”。决定第一次鲜明提出党的建设科学化的重大命题和重大任务，与党的十七大提出的以改革创新精神全面推进党的建设的总体部署一脉相承，引起海内外舆论高度关注。
提高党的建设科学化水平，首要的一条是坚持科学理论的指导。决定强调，坚持把马克思主义作为立党立国的根本指导思想，紧密结合我国国情和时代特征大力推进理论创新。
制度建设是党的建设的重要组成部分，也是提高党的建设科学化水平的重要方面。决定从坚持改革创新、增强党的生机活力的高度，对建立健全以党章为根本、以民主集中制为核心的制度体系作出了具体安排。
科学方法的运用，对提高党的建设科学化水平至关重要。“建立党委新闻发言人制度”，“办好党报党刊和党建网站”，“建立全国党员信息库”，“加强党员动态管理”，2010年底基本完成“农村党员干部现代远程教育网络一体化建设任务”，“健全反腐倡廉网络举报和受理机制、网络信息收集和处置机制”……决定中这一系列党建工作新方法，既继承和发展了党在长期实践中积累的成功做法，又充分体现了现代管理学、组织学、心理学等现代科学方法的理念。