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第五章财务验收结果及相关责任
第三十一条重大专项财务验收结论分为“通过验收”和“不通过验收”两种。
项目（课题）综合得分总分值为100分，综合得分高于80分（包括80分）为“通过验收”；综合得分低于80分为“不通过验收”，其中，综合得分高于60分（包括60分）且低于80分的项目（课题）按照本办法第二十八条规定执行。
第三十二条项目（课题）通过验收后一个月内，各项目（课题）承担单位应当办理完毕财务结账手续。项目（课题）经费如有结余，应当按照相关财政财务制度处理。
第三十三条对于财务验收抽查工作中发现的问题，牵头单位及项目承担单位应当及时进行整改，并将整改情况报送财政部。财政部根据整改情况及专家组意见调整验收结论，按照规定作相应处理。
第三十四条到期无故不申请验收、验收未通过的项目（课题），项目（课题）负责人不得再申报重大专项项目（课题），项目（课题）承担单位5年内不得再申报重大专项项目（课题）。
第三十五条在财务验收过程中发现弄虚作假，截留、挪用、挤占重大专项资金等行为，按照有关规定追究相关责任人和单位的责任；涉嫌犯罪的，移交司法机关依法追究刑事责任。
第三十六条在财务验收过程中，验收专家组成员、会计师事务所等专业机构人员、相关管理人员和相关机构有弄虚作假、徇私舞弊等行为的，终止或取消其参与重大专项财务验收工作的资格。有违反国家法律法规行为的，按有关法律法规处理。
第六章附则
第三十七条各牵头单位可以依据本办法，结合专项的特点，制定相应的项目（课题）财务验收管理实施细则，报财政部备案。
第三十八条项目（课题）承担单位组织财务验收所需经费，在其项目（课题）经费的间接费中列支；牵头单位组织财务验收所需经费，在牵头单位管理费中列支；财政部组织财务验收所需经费，在三部门管理费中列支。经费的开支内容和标准严格按照《民口科技重大专项资金管理暂行办法》（财教[2009]218号）和《民口科技重大专项管理工作经费管理暂行办法》（财教[2010]673号）执行。
第三十九条本办法由财政部负责解释，自发布之日起实行。