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下载安装Flash播放器（三）嗜粒细胞无形体核酸PCR检测。
目前，国际推荐使用16S rRNA基因检测方法，有条件的实验室，可进一步选用热休克蛋白基因groEL扩增方法。
1. DNA提取
用急性期、未使用抗生素的EDTA抗凝血或非抗凝血血球部分、白细胞及蜱研磨液提取DNA。最后，以AE缓冲液50µl抽滤以提高回收的DNA浓度。如采用血液白细胞层提取DNA，可明显提高阳性检出率。实验时，应采集当地正常人血液同时提取DNA，作为PCR的阴性对照。
2. PCR扩增
（1）16S rRNA基因检测：16S rRNA 高度保守，是PCR检测最常用的扩增靶基因，巢式PCR检测可提高检测灵敏度和特异度，采用属特异及种特异引物同时进行检测。PCR检测应分区进行，避免污染。使用引物序列见表1。
表1 巢式PCR检测无形体及埃立克体16S rRNA基因常用引物
|
引物名称 |
序 列 |
片段长度(bp) |
|
Eh-out1(AF414399) |
5’-TTG AGA GTT TGA TCC TGG CTC AGA ACG-3’ |
653 |
|
Eh-out2(AF414399) |
5’-CAC CTC TAC ACT AGG AAT TCC GCT ATC-3’ |
|
|
Eh-gs1(AF414399) |
5’-GTA ATA CT GTA TAA TCC CTG-3’ |
282 |
|
Eh-gs2(AF414399) |
5’-GTA CCG TCA TTA TCT TCC CTA-3’ |
|
|
HGA1 |
5’-GTC GAA CGG ATT ATT CTT TAT AGC TTG -3’ |
389 |
|
HGA2 |
5’-TAT AGG TAC CGT CAT TAT CTT CCC TAC-3’ |
PCR反应混合物的准备按常规进行。第一轮反应采用外引物对Eh-out1和Eh-out2，DNA模板10µl（白细胞提取的DNA可适当减少）。PCR反应体系总体积为25µl或50µl（需要进行PCR测序或克隆时，应适当扩大反应体系），其它成分的浓度按常规进行。反应程序如下：
94℃ 5min
40循环：94℃ 45sec
55℃ 50sec
72℃ 1min
72℃ 总延伸 5min
第二轮反应使用2对引物分别进行巢式PCR。2对引物分别是无形体属及埃立克体属通用内引物（Eh-gs1、Eh-gs2）；以及HGA种特异性引物（HGA1及HGA2）。检测样本取第一轮产物1-2µl为模板，阳性对照取0.5µl为模板。反应程序同第一轮反应。
（2）热休克蛋白基因groEL扩增
与groEL基因的应用相比，16S rRNA基因的应用更为广泛，但groEL基因在不同种属间具有较大的变异性。因此，对于诊断及菌株的鉴定，groEL基因均具有重要意义。该基因扩增使用巢式PCR，引物序列见表2。
表2 groEL基因扩增常用引物
|
引物名称 |
序 列 |
退火温度 |
片段长度bp) |
|
HS1 |
5’-TGG GCT GGT A（A/C）TGA AAT |
52℃ |
1431 |
|
HS6 |
5’-CCI CCI GGI ACI A（C/T）ACC TTC |
||
|
HS43 |
5’-AT（A/T）GC（A/T） AA（G/A）GAA GCA TAG TC |
55℃ |
HGA480 |
|
HS45 |
5’-ACT TCA CG（C/T）（C/T）TCA TAG AC |
HME528 |
DNA提取同上。PCR检测时，反应混合物的准备按常规进行。DNA模板量同16S rRNA基因检测。巢式PCR第一轮反应采用外引物对HS1及HS6。
反应程序如下：
3循环：94℃ 1min
48℃ 2min
70℃ 90sec
37循环：88℃ 1min
52℃ 2min
70℃ 90sec
68℃ 总延伸 5min
第二轮PCR引物采用HS43及HS45。检测样本取第一轮产物1-2µl为模板，阳性对照取0.5µl为模板。反应程序同第一轮反应。反应程序同第一轮反应，但退火温度由52℃改为55℃。
3．测序及分析
对扩增产物进行测序并进行同源比较，分析当地流行株与其它地区的变异性。