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大陆欠缺有影响力的学术大师
调查认为，大陆高校欠缺有影响力的国际学术大师。
论文被引次数是国际上公认的反映学术研究影响力的主要指标。汤森路透公司开发的“高被引科学家”数据库（2009年）统计公布了近30年来在21个学科内全世界论文被引次数最高的科研人员。
港台高校都有多名科学家进入这个数据库，而大陆仅有中国科学技术大学材料学专家钱逸泰、北京航空航天大学材料学专家张涛入闱。
报告还提出，大陆高校教师队伍整体质量有待提高。
有博士学位的教师比例是反映大学师资队伍整体质量的重要指标，大陆及港澳台地区大学中博士学位教师比例在90%以上的有10所，全部是港台大学，其他进入排名的港台大学的博士学位教师比例也大多在80%以上，大陆地区只有北京师范大学一所学校博士教师比例超过80%。
在调查研究期间，程莹博士与香港、台湾、澳门多所高校的校长、普通教师进行了广泛接触和访谈，对于大陆及港澳台地区的差异深有感触。
程莹博士介绍，港台高校享有较大的办学自主权，政府对大学的干预较少，比如香港科技大学在创校时政府就投入巨资，但对学校办学几乎没有任何要求和干预。与自主办学相适应的就是教授治校，港台高校注重制定大学章程，依“法”保障教授在各类学术事务中的主导性地位。
大陆高等教育的行政化色彩仍然较浓，宏观上教育主管部门仍然保留了大量的审批权，高校内部管理中，在招生录取、教师晋升、校内经费资源分配等与学术有关的问题上，普通教师能发挥的作用非常小。