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香港高校办学经费最充裕
这份报告对各高校在科学研究上的表现给予了更多关注。报告显示，大陆高校整体实力雄厚，港台高校师均表现领先。
从近5年在Nature（《自然》）和Science（《科学》）两本国际顶尖刊物上发表的论文数来看，前三名分别是北京大学、中国科学技术大学和南京大学，前十名（11所）中大陆大学有7所；但是，师均（总量除以教师数）发表Nature和Science论文最多的是台湾的阳明大学。
年度发表SCIE（科学引文索引扩展版）和SSCI（社会科学引文索引）论文最多的是大陆的浙江大学，前十名中大陆高校有8所；但是师均发表SCIE和SSCI论文的前十名大学中，大陆高校只有中国科学技术大学一所，排在第九位，其他9所全部是港台高校。
香港特别行政区经济发达，大学的办学经费也最为充裕。办学总经费和生均经费排名第一的都是香港大学，生均经费排名前十名的大学中香港的大学有7所，总经费排名前十的大学中香港的大学有4所。
大陆地区的清华大学和台湾地区的台湾大学的办学总经费和生均办学经费排名也比较靠前。
报告负责人程莹博士介绍，港台高校的科研经费中来自政府部门的比例一般都很高，如台湾大学、成功大学、台湾“清华大学”以及香港中文大学、香港理工大学等高校，政府科研经费的比例都在90%以上。
而大陆高校的科研经费中来自企事业单位委托的比例相对较高，特别是清华大学、浙江大学、上海交大等工科强势的学校，政府科研经费的比例都不到2/3，而企业科研经费的比例都在30%以上。
“这一方面反映了大陆名牌大学向社会提供科研服务的意识和能力较强，但也说明他们精力较分散，可能在承担基础性科学研究上投入不够。” 程莹博士说。