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为了确保普查成功，国家统计局提前3年就启动了人口普查准备工作。从2007年8月在江西进行外出人口试点调查开始，到2010年11月进行入户登记，3年多艰苦细致的备战，逐步拿出了对策。
破解流动人口普查登记难题是关键。科学设计普查方案至关重要，流动人口普查质量的好坏关系到整个人口普查数据质量的高低。
第三次全国人口普查的重登率为千分之零点一五，第四次人口普查的漏登率为千分之零点六，但第五次人口普查时漏登率竟达到了百分之一点八一。问题出在哪呢？原来是仅仅按常住人口原则进行普查登记容易出现疏漏。
第六次全国人口普查专家组组长卢春恒解释说，第五次全国人口普查时规定，除了“居住在本乡镇街道(含外出时间不足半年者)，且户口在本乡镇街道”的人是本地的常住人口外，那些“在本乡镇街道居住半年以上，或居住在本乡镇街道虽不到半年但离开户口登记地已经半年以上的人”也要作为本地的常住人口进行登记。这一规定本身是清楚的，但普查登记时容易出问题。例如，一个人离开原住地超过半年，但相继流动了几个地方，在每个地方待的时间都不到半年。按规定，这个人在流出地不用登记，而应在普查时他所在的流入地进行登记。可如果流入地普查员在登记时询问不仔细，只是简单地询问到本地居住了多长时间，没有进一步追问离开户口登记地多长时间，就容易误将其视为离开户口登记地不足半年，应在户口登记地进行登记的人。从而出现在流入和流出地都没登记的疏漏。
为了避免这种情况，做到不漏不重，第六次全国人口普查采取“两头堵”的办法。也就是说，普查员逢人就查，见人就登。不仅在居住地登记，在户籍地也登记。两边登记之后，由计算机汇总软件根据事先设定的条件来剔除重复。
提高数据质量，既要靠方法创新，也要靠技术保障。这次普查首次借助了遥感影像来确定普查区边界，将全国960万平方公里土地、4亿多户人家，按照每个普查小区80户左右的规模，划分成550多万个普查小区，每个普查小区无缝衔接。
为搞好这次普查，有关部门给予大力配合，出台了相关政策保障。从2010年5月开始，公安机关就在全国范围内开展了户口整顿工作，翔实的户籍资料成为入户调查的依据。为解决超生人口漏报问题，统计、公安、计生等部门还联合出台政策，除规定普查结果不作为对超生户的处罚依据外，还制定了“超生孩子可以根据政策规定落户”的宽松政策。
在各方共同努力下，第六次全国人口普查各项准备工作就绪，只等普查标准时点的到来。