基因编辑技术:进展与挑战

发布时间:2018-11-16 17:15:50  |  来源:中国网·中国发展门户网  |  作者:卢俊南 褚鑫 潘燕平 陈映羲 温栾 戴俊彪  |  责任编辑:赵斌宇
关键词:基因编辑,重组核酸酶,CRISPR/Cas9,DNA介导的基因编辑

CRISPR/Cas12a 基因编辑技术

CRISPR/Cas9 技术受富含 G 碱基的 PAM 序列限制,不能实现任意序列的靶向。同时 Cas9 蛋白分子量过大,某些情况下不便使用。实际上几乎所有的古细菌和众多的细菌都采用 CRISPR/Cas 机制进行免疫防御,其中包含多种 CRISPR/Cas 系统。已经表征过的Ⅱ类 CRISPR/Cas 系统,均属于采用 Cas9 家族核酸酶作为效应因子的Ⅱ型 CRISPR/Cas 系统,而在普氏菌和弗朗西斯氏菌属(Prevotella 和 Francisella1)中存在另一个Ⅱ类 CRISPR/Cas 系统,其被归为Ⅴ型 CRISPR/Cas 系统。2015 年,张锋团队报道 V 型系统中的 Cpf1(CRISPR from Prevotella and Francisella 1)(现称“Cas12a”)是有功能的细菌免疫机制并能在人类细胞中介导有效的基因编辑。CRISPR/Cas12a 具有 CRISPR/Cas9 没有的优点,其中之一就是 Cas12a 需要的是富含 T 碱基的 PAM 序列,有助于其在基因组富含 A/T 碱基的物种中使用。上海科技大学的陈佳课题组将无 DNA 切割活性的 dCas12a 与大鼠源的胞嘧啶脱氨酶(APOBEC1)融合,发现其与基于 Cas9 的碱基编辑器类似,能有效地催化人类细胞中 C 到 T 碱基的转换。由于识别的是富含 T 碱基的 PAM 序列,基于 Cas12a 的碱基编辑系统能与基于 Cas9 的碱基编辑系统互补,为相关基础研究及将来的临床应用提供更全面的技术条件。

基于 CRISPR/Cas 系统的RNA编辑技术

除了对 DNA 进行编辑,张锋课题组发现 CRISPR 蛋白家族的 C2c2(现称 Cas13a)可以靶向切割 RNA,随后他们证实 Cas13a 可在哺乳动物细胞中靶向降低 RNA 的水平。利用 Cas13a 的 RNA 靶向功能,CRISPR/Cas13a系统被开发为 RNA 检测器用于疾病诊断。张锋团队后续又发现了 Cas13b,其同样具有 RNA 靶向和编辑功能。另外,Cas13c 和 Cas13d 也具有类似功能。RNA 编辑技术的建立,进一步拓展了 CRISPR/Cas 基因编辑技术的应用范围。

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