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下载安装Flash播放器“独立型环境税方案好，还是整合现有税收结构，将环境税融入资源税和消费税当中的融入型方案好呢？需要进一步研究。”国家发改委专家表示，独立型的好操作，但从税制结构优化、减轻企业负担角度，融入型方案可能更具持久性。
事实上，由于“环境”涉及多部门职能，环境税的设置自然不能脱离部门间的协调问题。目前，该方案只是明确了财政部门、环保部门和税务部门的职责，其他部门的角色，未能体现出来。
如方案显示，环保部门以监测为主，履行监测、核定等职责，税务部门负责征收，而财政部门把收取的环境税纳入财政收入体系。
“发改委气候主管部门是与CO2排放密切相关的部门，它在碳税中应该扮演什么角色？同样，发改委价格主管部门之前负责核定和监管污水处理费，确定环境税税率时是否仍然需要价格部门的参与？”一位财税专家表示。
该专家分析，在废水环境税上，作为供水行业管理部门的水利部和污水处理的监管部门的住建部，是否需要参与？具体怎么参与，都没有体现出来。这就蕴含着部门协调的难题。例如，根据现有方案，对居民生活污水免收环境税，那么是不是还要收污水处理费呢？
“如果说继续收取污水处理费，就会出现居民生活污水主要由水务部门收取，而工商业污水由税务部门收取。不同来源的污水有两套管理机制，污水处理厂处理不同来源的污水，费用机制不一样无疑会增加协调成本与管理成本。”业内人士指出。
环境税正效应：需与减税配备
作为一项重要的环境经济政策，环境税主要通过提高排放成本，促使企业减少排污行为。但专家们亦有忧虑，这一目标与现实操作起来的结果，可能存在差距。
“能不能更为有效地解决污染治理问题，还存在疑问。”中国农业大学法学系副教授王小龙表示。
“如果只是增加财政收入，那么我们国家的财政收入已经很高了，为什么还要征税？”国家发改委能源研究所副所长李俊峰对记者表示，“现在的问题不是要增税，而是如何用好已有的税款”。
从费到税，尽管都在约束企业行为，但“收上来的钱”的使用环节却发生了重大调节。即排污费由环保部门来收的，专款专用，用于治理污染环境，而排污税则是由税务部门来收的，是纳入地方财政大盘子，统筹使用，未必会直接用于环保。
同时，环境税也面临着与其他环境经济政策对接的问题。王小龙认为，“对SO2和COD来说，排污税和有偿使用费不能同时存在，只能选择收一种，否则就是重复收费。有关部门一方面在推环境税，另一方面也想推排污权有偿使用，但他们没意识到两者的冲突。”
“环境税是增税，同时国家也应调整税制结构，在所得税等环节减税，这样才能维持税负平衡。”上海金融与法律研究院研究员傅蔚冈对本报记者表示。