《杜仲全基因组精细图》绘制完成重大成果发布/实录
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- 胡文臻:
各位领导、各位专家，下午好！杜仲作为战略新兴资源产业，具有其独特的历史地位，有显著的经济发展优势，具有实现城镇化经济快速发展的现代经济可持续盈利的增长点，具有实现造林碳汇、改善区域生态环境，实现污染治理的环境治理特征。杜仲产业本身具有了新型橡胶资源培育、杜仲药品、食品、保健品开发的多项功能，同时还具备了天然无物料的饲料产品，涉及工业、林业、食品、饮料业、医药业、新型保健产业、军工业、畜牧业、板材包装业等9大行业，可以生产近百种杜仲产品。杜仲产业发展同样经历了改革开放和产业化不断发展，进行杜仲宣传和杜仲产业开发过程中同样存在不可逾越的三种矛盾关系。
2014-11-26 15:44:58
- 胡文臻:
第一种矛盾关系是杜仲产业60年来的发展与经济林中心培育的新杜仲橡胶资源优良品种之间的矛盾关系。
第二种是地方政府观望与企业积极开发杜仲产业的矛盾关系。
第三种是杜仲橡胶资源产品与综合利用产品与市场对接的矛盾关系。
2014-11-26 15:46:01
- 胡文臻:
第一种关系是中国杜仲资源占全世界的95%以上，约300万亩，而我们的杜仲技术成果却不如日本和前苏联。1952年周恩来总理关注杜仲产业以来，我国科学家、科研工作走过了60年个头，尤其杜红岩研究员主持研究的杜仲良种华中5号和华中10号，国家认定和省级认定两种华中11号、华中12号等10个杜仲良种。这是培育杜仲橡胶资源的国家级认定的支撑型的杜仲良种，也是杜红岩团队30多年来的科研成果和巨大贡献。
目前国内27个地区可以种植杜仲，基本上是自然种植和野生传统的品种范围，它的枝皮、叶干、花果等资源加工利用率与经济林中心新培育杜仲橡胶资源的品种相比利用率非常低，因此杜仲产业绿皮书发布以来研究关注的是经济林中心培育的优良品种。经济林中心的优良品种解决了杜仲橡胶资源的技术问题，解决了多年来困扰地方政府企业、农户、高产加工杜仲橡胶资源需求量的增加和掌握高产培育技术的矛盾关系。
2014-11-26 15:46:31
- 胡文臻:
第二个矛盾是国内杜仲资源加工的传统型企业，主要采用传统的杜仲资源。杜仲橡胶加工技术主要是粗放型的，一些地区企业有简单少量的橡胶加工产品，资源采集控制利用率低。对经济林中心的新品种培育技术认识不到位，地方政府和企业都存在着观望。2003年杜仲调研项目组成立以来，推动了杜仲产业发展。许多公司与经济林中心开展了全方位的合作，率先建立基地，培育新杜仲品种。其中甘肃润林中心与经济林中心和兰州大学合作研究，他们的技术比较了现有提取方法的优劣，提出了新的提取工艺，运用亚磷介萃取，该项技术填补了杜仲橡胶生物法提取空白。与此同时，上海华仲公司也展开了全面合作，在提取橡胶技术方面与经济林中心进行了紧密合作。甘肃润霖与兰州通用公司合作研究了杜仲橡胶成套设备加工技术，目前已经制造完成，也是我国第一个拥有杜仲橡胶成套技术设备加工企业，目前正在调试过程中。第一台全套设备安装已在润霖公司（音）进行调试。由此来看，经济林中心的新型培育资源种植培育引起了政府支持、企业的积极投资，国家发改委修订统一指南，国家林业局重视杜仲产业发展的相关规划政策和措施，从实践与技术层面基本解决了合理科学的杜仲产业发展路线，基本解决了地方政府观望与企业积极投资开发的矛盾关系。
2014-11-26 15:48:07
- 胡文臻:
第三种矛盾是新杜仲橡胶资源培育科研成果和杜仲产业发展的形势共同面临一个重要问题，就是大家所关注的如何在两至十年内逐步实现120万吨杜仲橡胶的问题，这也是相关部委、国情调研、杜仲项目课题组、科研机构过去合理布局解决新杜仲品种资源培育的问题，这也是国情调研李委员连续多年提案的战略思考问题。我们有数据说明新杜仲橡胶资源的经济价值和战略地位问题，相关技术说明传统杜仲资源一公顷可以加工80-100公斤杜仲橡胶，经济林中心培育的新品种一公顷可以加工400-600公斤的杜仲橡胶，如果与目前三叶橡胶的产量相比，一公顷三叶橡胶可以加工橡胶700-800公斤，每年我国橡胶量需要400万吨，由此可见经济林中心的新品种杜仲资源可以加工杜仲橡胶的经营价值、社会价值，占领资源地位是非常显著的。
2014-11-26 15:49:37
- 胡文臻:
通过长期调研杜仲种植培育利用荒山荒坡沙漠区域等可以种植的沙漠等区域，合理规划种植杜仲橡胶新品种，设计目标近来300万公顷及4500万亩，可以加工实现杜仲橡胶产量120万吨，可培育出粗加工3000亿元的杜仲产业经济。可以培育出精加工产业经济达到上万亿，可以解决100万人的就业。将形成我国独具生态资源经济特色和生态文化建设的新兴战略资源经济体系。这一生态资源经济体系是可以持续发展百年的。
2014-11-26 15:50:08
- 胡文臻:
研究解决这三对矛盾关系，更加合理科学地实现杜仲产业健康发展，我们探索了一条道路，即以国情调研杜仲项目课题组的研究为基本路径，实现跨学科的合作研究模式。这是解决杜仲种植培育新品种、杜仲造林碳汇发展过程中的系列矛盾关系的科学途径和方法。国情调研杜仲项目组中国社会科学院社会发展研究中心和中国林业科学院经济林研究开发中心在相关部委的支持下，已经形成了杜仲专家评估机制和研究团队，对具备条件的新建杜仲企业或发展多年的地方需要升级的杜仲企业、转型升级，经过国情调研组专家团队科学严谨合理的调研评估后，可以有序进行杜仲橡胶资源新品种的推广，以更加完善的技术标准，参与已有的生态环境保护与建设，合理和谐的自然融入区域关系，形成生态环境的安全形态。
2014-11-26 15:50:36
- 胡文臻:
我们希望适宜种植杜仲新品种的区域地方政府、企业认真研究这些合理的科学的应用对策研究。通过各个类型企业发展的合理布局，通过科研单位的技术支撑，政府与企业参与统一规划与科学建设，3到9年内逐步建成一支3家百吨千吨杜仲橡胶加工企业应该是比较现实的。我们再次学习马克思、恩格斯在共产党宣言中的第一章当中的精辟论，美洲的发现绕过非洲的航行，给新兴的资产阶级开辟了新天地。
2014-11-26 15:50:54
- 胡文臻:
今天杜仲产业市场的扩大，需求的增加，同样推动了区域生态经济的发展，这是我们要深入思考的生态发展问题，既要在外延方面扩大杜仲产业化市场战略，同时也要以杜仲新品种培育技术，从内涵方面来增加它的容量。马克思在政治经济学批判导言中指出，指出了生产消费辩证关系的原理，生产不仅依赖于消费，还可以通过市场转换消费，杜仲橡胶资源培育技术的贡献既提供了生态环境资源产品，又提供服务公众的消费产品，众所周知杜仲橡胶新品种产品问世以前，市场并没有对杜仲产品有直接的需求和战略需求，现在已经进入了新兴资源市场，必将引发市场产生新的新型消费需求，将成为区域、科研机构、地方政府、企业创造需求，进而开辟杜仲生产新领域的先导，将不断推动杜仲产业的生产与消费关系，更加合理地向深度和广度发展。
谢谢！
2014-11-26 15:51:36
- 孙伟平:
杜仲全基因组测序和精细图的绘制工作是在武汉未来生物组科技有限公司的支持下完成的，下面我们请武汉未来组生物科技有限公司公司CEO王德鹏讲话。
2014-11-26 15:51:55
- 王德鹏:
杜仲基因组研究中的技术革新是第三代技术的应用。我们知道，植物基因组的研究从2000年12月在《自然》上发表了第一个基因组，后来中国主持的水稻基因组的发布，都给植物的研究带来了非常大的机遇。以前只能进行一对一对基因的研究，现在可以一次性研究几万个基因，可以把任何物种在没有基因组学的条件下一次性把这些基因全部找出来，然后一个一个进行研究。从2000年到现在为止，我们陆陆续续看到非常多的植物基因组都发布在国际顶尖的杂志上，像《自然》。
2014-11-26 15:52:20
- 王德鹏:
对林木基因组来讲一直非常有挑战。我们知道，大部分林木并没有经过长时间的驯化，大部分还处于野生的状态，所以它有一个非常大的特点，杂合度非常高，也就是说基因组里面的分子之间非常的不同，并不是重合的样本。林木的基因组重复序列一般比较高，大部分的林木基因组比较大，甚至一部分的林木是多倍体，我们人只能是2倍体，人多一条染色体都会出严重的问题，但植物里很多是多倍体，2倍、4倍、6倍。
杜仲基因组特征。我们当时选择杜仲做基因组的原因是感觉到杜仲是一个比较复杂的物种，它是比较古老的，后来通过我们基础的预试验发现杜仲基因组杂合度达到1.1%，是杨树基因组的4倍，基因组大小是1.02GB，是杨树基因组的2倍多，重复序列比例高超过66%是高度复杂的植物基因组。
一般来讲在以前我们如果做一个植物基因组都会选用第二代的测序技术，第一代的测序技术实在太贵了，做人类基因组花30亿人民币，做水稻基因组花了1.3个亿。现在的植物基因组是通过二代测序，二代测序尽管便宜但是很短，不适合很复杂的基因组测序，所以我们把目光投向了第三代测序，目前这个测序技术的读长是10K-15K，测序的通量基本上能够满足我们的要求。
2014-11-26 15:53:33
- 王德鹏:
传统的方法，用二代的测序技术来做是构建一个短片断。像杜仲这样的复杂基因组，二代技术就要建大文库，这样的技术策略就会成本非常高。如果杜仲基因组用这种方法来做可能需要500-1000万人民币，这显然是不可接受的。所以我们采用了技术上的创新，结合二代的很便宜的测序，但是很短，和三代很长的读数，但是稍微贵一点的技术，我们混合组装。第一阶段得到的结果惨不忍睹，我们完全没有预想到它的复杂程度。我们第二阶段调整了策略，加入了第三代测序，一开始只建了10K的文库，后来增加了20K的文库，数据上可以看出来，从最开始的测序读长达到3K左右，到后面基本上达到5K、6K，随着我们技术的提升读长越来越长。
这个过程中我们感受到很多痛苦。比如说有一次程序跑了两三个月，1G的内存消耗了。有一次调试挂了10T的硬盘，一次参数设置我们运算是跑1年才能跑一次组装，经过30多次的调整最终得到了现在的结果932K的Scaffold的片断，我们认为这个结果已经非常满意。
11月10日《自然》上有一篇文章，用第三代测序做人类基因组。我们可以预测今后动植物基因组甚至可以做到接近完成图，这样的基因组无论是否复杂，不管它有多大，可能都能够基本上把这个基因组装起来，并且基本没有太多的洞。
这就是我们要汇报的内容。谢谢各位！
2014-11-26 15:55:09
- 孙伟平:
非常感谢王德鹏先生，基因的测序是一项前沿性的成果，也是我们国家非常值得骄傲的，与国际上基本同步的比较领先的技术领域。深圳华大基因都是我国在生物基因测序方面走在世界前列的公司。刚刚王总介绍了杜仲基因测序过程中面临的困难、挑战，给我们介绍了杜仲基因测序过程中怎么样克服了这些困难，解决这些问题的，也使得我们对杜仲基因测序有了更加清晰、更加全面的了解，非常感谢王总。
2014-11-26 15:56:46
- 孙伟平:
各位领导、各位专家，各位新闻界的朋友，现代杜仲产业是一个新兴产业，现代的杜仲事业刚刚起步，相信大家来到这个会场可能都有很多话想说，但由于时间有限，我们对来的很多领导和专家这里不再安排发言了，大家会后可以自由交流。
杜仲产业发展潜力不可限量，发展前景非常广阔。杜仲生产效益、经济效益和社会效益非常巨大，在这里我们恳请各位领导、专家、新闻界的朋友们今后继续关心支持和参与杜仲事业，让杜仲价值得到充分发挥，为美丽中国的建设，为中华民族伟大复兴中国梦的实现，作出“杜仲人”应有的贡献。《杜仲全基因组精细图》绘制完成重大成果暨《中国杜仲图志》等科研成果新闻发布会到此结束，谢谢大家的光临！
2014-11-26 15:57:43