中国首个国家基因库:外观像梯田 里面学问大[图]

发布时间: 2016-09-23 10:52:06  |  来源: 中国发展门户网  |  作者: 戴凡 张若梦  |  责任编辑: 魏博
关键词: 基因库,梯田,冗余数据,RevolocityTM,大科学

  航拍国家基因库。 深圳国家基因库 供图

中国网22日深圳讯(记者 戴凡张若梦)9月22日上午, 深圳国家基因库举行启动仪式,标志着我国首个、也是唯一一个获批筹建的国家基因库正式运营。

据国家基因库执行主任徐讯介绍,此次宣布启动的国家基因库数字化平台装备了150台BGISEQ-500型测序仪和1台RevolocityTM测序仪,目前总数据产量将达到每年5Pb,相当于一年5万人全基因组或是1000万产前筛查的数据产出规模,升级后的系统预计年产数据可达10Pb,将成为全球最大的数据产出平台。同时,宣布启动的国家基因库开放数据中心,已经建成了20Pb数据的可访问能力,并规划在二期完成500Pb的可访问能力,能力上超越国际三大基因数据中心,填补了我国长期缺少国家级基因数据中心的空白。该数据中心首批将对公众开放1Pb的非冗余数据的检索和比对服务,涵盖罕见病、癌症、肠道菌群、农业、物种多样性等13个高质量的数据库,将大大促进全球生命科学领域的进步,在疾病诊断和治疗、农业新资源的开发和利用、物种和生态多样性保护等基因相关产业的发展中也将起到重要的推动作用。

深圳国家基因库主任梅永红表示,国家基因库将继续以服务国家战略需求作为出发点,融合近年来生命科学学科的国际前沿动向,进一步完善 “三库两平台”的业务结构,扮演好公共服务平台的角色,形成从资源到科研、产业的全贯穿全覆盖的模式,实现大资源、大数据、大科学、大产业的联动。

据了解,国家基因库基地位于深圳市大鹏新区大鹏街道下沙片区“禾塘仔”地块,分两期建设。目前,一期建筑面积47500平方米已经全部完工,建筑融合了梯田、山石、桃花源的设计理念和生态、生产、生活融合的运维原则,是一个层层梯田种植屋面、混泥土本色与垂直绿化相结合的低碳生态建筑。

在业务和功能建设方面,深圳国家基因库已经初步建成了“三库两平台”的功能和结构,包括生物资源样本库(湿库)、生物信息数据库(干库)、生物活体库(活库)及数字化平台(读平台)、合成及编辑平台(写平台)。其中,样本库已储存样本超过1000万份;信息库建成十余数据库、统一检索系统及强有力的数据传输、云计算等支撑实力;数字化平台年产数据5Pb以上;合成与编辑平台,启动超高通量、超低成本的基因组合成与编辑产能的规划和部署;活体库致力于保护和保存世界约三十万种植物、百万种动物、近千万种微生物活体资源,并已启动瑞丽植物园数字化项目,促进资源数字化和多组学研究,实践其创新性应用。

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