我国战略生物资源大数据及应用

发布时间:2020-01-22 10:53:42  |  来源:中国网·中国发展门户网  |  作者:梁卓 褚鑫 曾艳等  |  责任编辑:杨霄霄
关键词:生物资源,信息化,大数据


中国科学院在资源整合共享和数据管理利用方面的进展

中国科学院作为国家战略科技力量,历来十分重视生物资源的保存、利用与共享。在中国科学院战略生物资源服务计划整体框架下,依托中国科学院微生物研究所成立了中国科学院战略生物资源信息中心。该中心以中国科学院在生物资源领域的雄厚积淀为基础,全面整合中国植物园联盟、国家标本馆体系、全国微生物和细胞资源应用网络、模式与特色动物实验平台利用联盟、中国生物多样性监测与研究网络资源数据信息,旨在实现数据共享,开展数据挖掘,提升数据价值,支撑战略生物资源领域科学研究以及社会应用。同时,该平台通过开展战略生物资源领域国内外信息搜集整理和分析,提供政策咨询参考,支撑科学决策,将保存的生物遗传资源转化为数据资源,实现实物资源信息的高效共享服务,并为国家相关部门和国际履约提供技术支撑。

为规范和加强中国科学院战略生物资源服务计划的项目数据汇交工作,促进项目数据的共享,中国科学院科技促进发展局牵头制定了《中国科学院战略生物资源服务计划数据管理及标准规范》,其内容包括“数据管理及汇交办法”和“标准规范”两部分。“数据管理及汇交办法”对服务计划中的数据汇交计划、数据汇交内容、数据汇交流程、汇交数据管理、数据使用与知识产权等内容进行了明确的规定。“标准规范”部分按照不同资源类型及其子类,对需要汇交数据的详细内容、数据格式和样例给出了详细的要求。为促进生物资源数据被尽可能广泛和自由地共享和使用,实现数据的规范管理、有效利用和增值服务提供了参考和依据。

中国科学院战略生物资源信息中心开发了我国战略生物资源对外信息共享门户和综合服务平台。作为我国重要战略生物资源的基础数据平台,该平台提供统一的检索入口和并行综合查询,发挥其核心数据目录的作用,为我国的生命科学研究以及生物技术的发展提供重要的数据支撑。依据中国科学院战略生物资源服务计划数据标准规范建立的在线目录资源数据管理平台,可以按照各个资源领域及其数据提交单位设立不同的管理权限,并可通过基于网页方式的数据管理平台,建立多级的数据上传、同步和发布等功能,从而有效支撑了全院各资源领域、各资源中心的数据汇交、实时发布和在线统计。利用数据管理工具,形成了各保藏单位、工委会、总中心的三级数据汇交体系,并汇总形成中国科学院战略生物资源目录(图 1)。利用该目录,可以数据按照来源、物种、生存状态、共享方式等多种类型进行统计,并能进行多样化的在线检索和数据展示。

中国科学院战略生物资源服务网络信息平台致力于涵盖中国科学院内标本馆、植物园、典型培养物、实验动物和生物多样性监测网络,进行整体布局和顶层设计(表 1)。该平台建立了一系列生物资源数据的收集、保护、研究、管理与利用等基础数据的采集、加工、处理与交换的标准规范;整合了中国科学院生物资源数据库,彻底理清了中国科学院生物资源的家底;建立了统一的数据服务平台和完备的数据交换与共享机制,建立了全院统一的资源目录和信息门户,包括各单位馆藏的元数据信息、全院综合资源目录及信息门户,从而提高中国科学院生物资源保护、研究与管理水平,促进战略生物资源面向社会的应用和服务水平。



 思考及讨论

在大数据的背景下,未来的生物资源研究必将朝着形成一个全方位的生物资源研究、开发与应用的网络的方向发展,各个环节的联系更加紧密,对数据应用也必将提出更高的要求。系统、全面、科学地搜集、整理我国生物资源信息,不仅可以将其用于生物多样性保护和生物资源的合理开发和利用,而且可以应用到以生物学为基础的各个方面,推动中国生命科学研究的快速发展,进而影响生物经济的各个领域。因此,建立战略生物资源综合信息服务平台不仅是基础科学发展的客观要求和必然趋势,也是国民经济和社会可持续发展的需要。随着我国国民经济建设的飞速发展,各行各业要求生物学家提供越来越多的生物资源信息。中国科学院战略生物资源综合信息服务平台通过整体布局和顶层设计,为生物资源的系统化、集约化保存、研究和功能评价提供全方位的信息支撑;通过建立信息集成和服务平台,向全社会开放、共享资源,凸显生物资源对经济社会发展的重要支撑服务作用。未来,中国科学院还将以该信息平台为基础,开展生物资源搜集和功能研究的广泛的国际合作。通过开展联合测序、数据分析等共同研究,对生物资源进行研究及功能评价,拓宽我国资源搜集渠道,为生物技术应用提供基础。



(梁卓,中国科学院科技促进发展局;褚鑫,中国科学院重大科技任务局;曾艳,中国科学院科技促进发展局;周桔,中国科学院科技促进发展局;马俊才,中国科学院微生物研究所。《中国科学院院刊》供稿)


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