面向生物合成的代谢工程策略设计

发布时间:2018-11-16 17:16:37  |  来源:中国网·中国发展门户网  |  作者:马红武 陈修来 袁倩倩 刘立明 孙际宾  |  责任编辑:赵斌宇
关键词:计算设计,代谢工程,生物合成,动态调控,代谢网络,合成生物学

图1由代谢网络分析确定聚3-羟基丁酸酯(P3HB)合成最优途径

(a)常规途径由于丙酮酸脱氢步骤的碳损失1个葡萄糖(6个碳原子)只能生成1个P3HB(4个碳原子),碳摩尔得率为0.67;(b)通过代谢网络模型计算得到新途径通过苏氨酸循环由1个葡萄糖得到1.28个P3HB,碳摩尔得率提高到0.85。新途径的实现可显著降低原料成本

外源基因的引入不但可以使细胞从无到有获得合成新产品的能力,也可以形成新的途径提高已有产品的得率。Bogorad 等通过在大肠杆菌中引入来源于 B. adolescentis 的戊糖/己糖磷酸转酮酶(Fxpk)构建了非氧化酵解途径(non-oxidative glycolysis,NOG)。通过该途径可以实现 1 个葡萄糖生成 3 个乙酸,即完全没有碳损失(图 2)。我们在大肠杆菌 iJO1366 模型中引入该反应后通过 FBA 分析对上百种生物产品的理论得率进行了计算,发现至少有几十种生化产品的得率都有了显著提高。在这一计算结果指导下,构建了含 NOG 途径的大肠杆菌菌株并分别用于 P3HB、丙酮和异丙醇的生产。改造后的菌株与出发菌株相比得率均有显著提高。最近 Meadows 等将 NOG 途径引入到酿酒酵母细胞中构建了法尼烯合成细胞工厂,最终菌株法尼烯对葡萄糖的碳摩尔得率由 0.52 提高到 0.65。

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