香港卫生防护中心将于2009年底前设立传染病通报电子平台，增强定点监察系统侦测社区疫症的功能。针对“风险前所未有地高”的艾滋病感染趋势，防护中心除会于本年进行首项艾滋病感染个案的群组研究，更会设立艾滋病电子平台，与珠三角地区13个城市交换感染数据。

据香港明报报道，香港卫生防护中心发表《防控传染病策略计划2007-09》，针对传染病监测；肺痨、艾滋病病毒及性病监测；疫苗可预防疾病；及医护环境感染情况等各方面，订下一系列具体目标，当中计划于09年底前设立传染病通报监测电子平台。中心亦会先于明年底引入“计算机化异常侦测方法”监察传染病。

针对珠三角艾滋病病毒传播的风险，防护中心更会推出多项策略，包括在本年进行首项艾滋病病毒感染者，及艾滋病患者的群组研究，明年底前亦会强化电子平台，与珠三角地区13个城市交换艾滋病感染数据情报；就性病的社区监测，防护中心亦将加强性病伴侣呈报监察系统。

防护中心总监梁柏贤12日于立法会卫生事务委员会会议上表示，珠三角目前亦正就流感监测电子呈报作研究。除SARS、禽流感或流感大流行外，本港未来数年需特别注意的传染病包括食物中毒(如O157:H7大肠杆菌)和EV-71肠病毒；经病媒传播的登革热、西尼罗河热、日脑，甚至与生化恐怖活动相关的炭疽病。

至于疫苗可预防的疾病，防护中心未来数年的重要工作是要达到世卫定下，在2012“消除麻疹”和“控制乙型肝炎”的目标，其中香港目前的麻疹病发率仍高于世卫要求水平。梁柏贤亦称，推行防疫注射减低传染病风险。