《零号特工》第一集

四十年代初，延安的一所小学教室内，两个人正在秘密进行交谈。其中一个是教师李文鼎，他的真实身份是中共的头号特工，代号零……

阴雨绵绵的上海笼罩着一层乌云，中统上海站站长北冥带队袭击了中共上海地下总站，目的是为了中共的通讯密码和筹措多年的经费。军统上海站的站长靛青也加入了混战中，经过交战，中共上海站站长卢戡被杀，北冥也被代号“沧海”的中统刘仲达出卖并开枪打死。代号“客人”的神秘男子在军统的层层监视下趁乱向延安发出急电——惊蛰……

《零号特工》第二集

三十四通知零随时准备出发。为了让零顺理成章地离开延安，三十四说零是反贼，并以督导的身份把他革除出了学校……

此时的上海一片阴晦，刘仲达带着军统对中共在上海所有的交通站进行了袭击。当他们在袭击最后一个交通站的时候，却遭到了埋伏在此的中统的偷袭，刘仲达受伤……

在大车店，一位交通员告诉零三十四的行走路线，交通员还告诉零，此次要面对的敌人是马贼“天星帮”，“天星帮”头领的真实身份是军统西北站站长，代号湖蓝。

广阔的沙漠中，出现了马队，正是湖蓝带领的“天星帮”……

《零号特工》第三集

打头阵的交通员把湖蓝的注意力吸引到自己身上，经过搜查，湖蓝没有搜到他想要的东西，他想要的是共产党由延安带出的通讯密码……

零和三十四都踏上了前往三不管的路途……

两不管沙漠，湖蓝截住了零的去路，零以一个穷教书匠的身份骗过了湖蓝。三十四也以国民政府教育部官员的身份顺利地通过了湖蓝的盘查……

三十四很快到达了三不管镇，由于出关的关卡已经关闭，他只有住进了阿手店。夜幕降临，徒步走来的零也到达了三不管镇，一路的艰辛已使他筋疲力尽。在这个阴森的小镇，他遇到了中统西北站站长鲲鹏，被毒打一顿，昏倒在阿手饭店外……

《零号特工》第四集

整个三不管镇充满了火药味，湖蓝放话要血洗三不管，这里随时都有可能变成战场。三十四找到了负责关卡的军官，说明自己的来意后，军官告诉他，要想出关就得交三百块钱……三十四带着几个士兵到阿手店把零抓了起来，声称零是从延安来的危险份子，军官认为三十四是耍花招，把零和三十四都赶了出去。零对三十四花钱买路的作法很不理解，但三十四没有作出任何解释。

湖蓝从交通员口中得到了六个字：三十四，三不管。果绿带着一批手下来到了三不管，并住到了阿手饭店，零和三十四陷入了险境……

《零号特工》第五集

果绿来了三不管之后，鲲鹏心里没了底，他命令手下四处搜索湖蓝，但没有发现湖蓝的踪迹，鲲鹏再次开始挑衅。湖蓝收到果绿的信号后，带领手下席卷而来。一场激战后，中统溃不成兵，鲲鹏死在湖蓝的枪下……

三十四不顾零的劝阻，买通负责关卡的军官，匆匆离开了三不管。湖蓝得知消息后，并没有追捕，他认为密码仍在三不管，于是开始清查。共产党、中统、日本人潜伏在三不管的特工无一幸免。当他看到零的时候，不由得吃了一惊，他没想到一个文弱的书生能徒步走过两不管沙漠，来到三不管……

《零号特工》第六集

三十四离开三不管后，湖蓝命令对其进行严密的监视。三十四刚回到西安，就被湖蓝安置在西安的军统监视起来……

湖蓝把零定为一号怀疑对象，让果绿想办法搜查零，他认为密码本就在零的身上，零被迫呆在阿手店里不准离开。果绿接到湖蓝的命令后，带着手下将整个阿手店翻了个底朝天，但仍一无所获……

被零杀死的那个日本特工引起了果绿的注意，零解释说是因为那个人想打劫他，他是因为害怕才杀了人。果绿自然不信，把阿手喊来对质，可零的态度很强硬，果绿被激怒了……